Российские ученые создали уникальный алгоритм для исследования белков

Ученые из ФИЦ Биотехнологии РАН разработали алгоритм для сопоставления аминокислотных последовательностей белков, который превзошел все зарубежные аналоги. Новый метод, названный MAHDS, позволит значительно улучшить исследование эволюционных изменений в белках, произошедших за сотни миллионов лет.

MAHDS (multiple alignments of highly diverged sequences) представляет собой математическую модель для выравнивания белков, которые сильно различаются на эволюционном древе. С помощью этого метода можно обнаружить общие признаки в структуре белков, которые влияют на их функциональные способности в клетке. По словам специалистов, использование этого подхода поможет не только понять механизмы эволюции белков, но и проследить родственные связи между различными организмами.

В ходе исследований российские ученые сравнили эффективность MAHDS с другими популярными методами, такими как AlphaFold, T-Coffee и MUSCLE. Для этого был проведен эксперимент с 490 белковыми семействами. В 138 случаях, когда сходство последовательностей было минимальным, только российская модель смогла правильно сопоставить данные. Другие алгоритмы дали случайные совпадения фрагментов, что показало их низкую точность в решении этой задачи.