E-veselības sistēmai ir veikti vairākkārtēji trešo pušu neatkarīgie drošības auditi. To rezultāti apliecina, ka sistēma ir aizsargāta pret drošības apdraudējumiem, vēstulē Saeimas Sociālo un darba lietu komisijai norādījis Veselības ministrijas (VM) valsts sekretārs Aivars Lapiņš.