Jeho dílo je postupně zapomínáno, Frank Zappa ale platí za jednoho z nejgeniálnějších a nejvšestrannějších muzikantů 20. století. Právem si vysloužil obdiv statisíců fanoušků, jedním z nich byl i Václav Havel, první český prezident. Excentrický hudebník zanechal nesmazatelnou stopu i v tuzemském undergroundu, dle písně Plastic People se pojmenovala kapela v čele s Mejlou Hlavsou.