Состояние внутренних водных путей оказывает решающее влияние эффективность работы транспорта в целом
Снижение строительства и обновление флота в последние годы, а также непроведение реновации и глобальной модернизации, привело к моральному и физическому устареванию флота. Более половины единиц флота, эксплуатирующихся на внутренних водных путях, имеют срок эксплуатации свыше 25 лет, что никак не может не отражаться на безопасной эксплуатации флота, а также приводит к увеличению стоимости ремонта и времени простоя судов. В связи с таким состоянием флота организации, осуществляющие перевозки на внутреннем водном транспорте, в недостаточной мере представляют свои услуги и не в полной мере выполняют требования действующего законодательства.
Состояние внутренних водных путей оказывает решающее влияние на показатели использования транспортного флота и эффективность работы внутреннего водного транспорта в целом.Для стимулирования развития отрасли необходимо решить вопрос о приоритете строительства судов для Байкало-Ангарского бассейна.
Стоит отметить проблему нехватки специалистов внутреннего водного транспорта. Данная проблема обусловлена тем, что обучение специалистов водного транспорта по совмещенным профессиям в учреждениях высшего и среднего профессионального образования на бюджетной основе не производится, а также низким уровнем оплаты труда работников Администрации.
Не стоит забывать и о вопросах транспортной доступности.
В настоящее время субсидии из областного бюджета выделяются на возмещение недополученных доходов, связанных с оказанием услуг по пассажирским перевозкам водным транспортом только в межмуниципальном сообщении на территории Иркутской области, что создает неудобство (высокая цена билета) и затрудняет перемещение пассажиров по маршрутам на протяженных участках рек, в том числе пересекающих границы области.