Ольга Кобякова возглавила ЦНИИ организации и информатизации здравоохранения
На посту начальника Томского облздрава руководила реализацией программы «Модернизация здравоохранения Томской области на 2011–2013 годы». В 2008 году создала кафедру общей врачебной практики СибГМУ.