معافیت از پرداخت مالیات مستقیم برای فعالیتهای اقتصادی در مناطق آزاد از تاریخ تصویب قانون چگونگی اداره مناطق آزاد و در ضمن ماده ۱۳ این قانون مورد التفات قانونگذار بودهاست؛ التفاتی که در آخرین مرحله ضمن ماده ۳۱ قانون رفع موانع تولید، بند ت. ماده ۱۳۲ قانون مالیاتهای مستقیم در سال ۱۳۹۴ تغییر یافت هر چند که به هر ترتیب مالیات در مناطق آزاد به مدت ۲۰ سال به نرخ صفر خواهد بود.
